ล่มสลาย ราชวงศ์ตองอู

แม้ว่าในช่วงระยะเวลาระหว่างการล่มสลายของอาณาจักรพุกามจะยาวนานถึง 250 ปี (1287–1555) แต่ช่วงระหว่างการล่มสลายของอาณาจักรตองอูครั้งแรกนั้นกินเวลาไม่นาน หนึ่งในบุตรของพระเจ้าบุเรงนอง คือ นยองยานมิน ได้เริ่มความพยายามในการรวมอาณาจักรใหม่ทันที และสามารถฟื้นฟูอำนาจส่วนกลางเหนือพม่าตอนบนและรัฐชานใกล้เคียงได้สำเร็จภายในปี 1606

ในปี 1535 พระเจ้าตะเบ็งชเวตี้ได้รวมดินแดนพม่าและก่อตั้งอาณาจักรพม่าครั้งที่สอง (ราชวงศ์ตองอู, 1535–1752) ซึ่งอาณาจักรนี้เกือบจะต้องทำสงครามตลอดเวลา โดยเฉพาะกับอาณาจักรอยุธยาในดินแดนที่ปัจจุบันคือประเทศไทย อาณาจักรตองอูต้องเผชิญกับการกบฏและการรุกรานของโปรตุเกส จนต้องถอยกลับไปตั้งหลักในพม่าตอนกลาง

ในช่วงกลางศตวรรษที่ 16 พระเจ้าตะเบ็งชเวตี้ ผู้ที่มีต้นกำเนิดจากภาคใต้ของพม่า พร้อมกับบุตรชายของพระองค์ได้รวมประเทศได้สำเร็จอีกครั้ง โดยได้รับความช่วยเหลือจากโปรตุเกส แต่ในปี 1599 อาณาจักรพะโคตกอยู่ภายใต้การปกครองของจักรวรรดิ์โปรตุเกสทางตะวันออก

ในปี 1613 อาณาจักรพม่าสามารถรวมตัวกันได้อีกครั้งและขับไล่ความพยายามในการยึดครองของโปรตุเกสอย่างถาวร แต่การกบฏของชาวมอญในภาคใต้ ซึ่งได้รับการสนับสนุนจากชาวฝรั่งเศสในอินเดีย ได้ทำให้อาณาจักรอ่อนแอลง และสุดท้ายก็ล่มสลายลงในปี 1752

พระเจ้าอนอคเพตลุน ผู้สืบทอดต่อจากพระเจ้าตะเบ็งชเวตี้ ทรงเอาชนะกองทัพโปรตุเกสที่เมืองสิเรียมในปี 1613 และยึดคืนชายฝั่งตอนบนของตะนาวศรีจนถึงทวายและล้านนาจากอยุธยาในปี 1614 นอกจากนี้ พระองค์ยังยึดครองรัฐชานทางตะวันออกของแม่น้ำสาละวิน (เชียงตุงและสิบสองปันนา) ในช่วงปี 1622–1626

พระเจ้า ธาลุน พระอนุชาของพระเจ้าอนอคเพตลุน ได้ฟื้นฟูประเทศที่ถูกทำลายจากสงคราม พระองค์ยังได้สั่งให้มีการสำรวจสำมะโนประชากรครั้งแรกในประวัติศาสตร์พม่าในปี 1635 ซึ่งแสดงให้เห็นว่าอาณาจักรมีประชากรประมาณสองล้านคน ภายในปี 1650 พระมหากษัตริย์ที่ทรงพระปรีชาสามพระองค์ ได้แก่ นยองยาน, อนอคเพตลุน และธาลุน ได้สร้างอาณาจักรที่เล็กลงแต่สามารถบริหารจัดการได้ง่ายขึ้น

ที่สำคัญกว่านั้น ราชวงศ์ใหม่ได้สร้างระบบกฎหมายและการเมืองที่เป็นพื้นฐานซึ่งยังคงใช้ต่อเนื่องไปถึงยุคราชวงศ์คองบองในศตวรรษที่ 19 อำนาจของหัวหน้าชุมชนที่เป็นกรรมพันธุ์ถูกแทนที่ด้วยผู้ว่าการที่ได้รับการแต่งตั้งทั่วหุบเขาอิรวดี และลดอำนาจของหัวหน้ารัฐชาน นอกจากนี้ยังควบคุมการเติบโตของทรัพย์สินและอำนาจของคณะสงฆ์ ทำให้ฐานภาษีกว้างขึ้น การปฏิรูปการค้าและการบริหารทางโลกสร้างเศรษฐกิจที่มั่งคั่งกว่า 80 ปี ช่วงเวลานั้นมีการก่อกบฏเล็ก ๆ น้อย ๆ และสงครามภายนอกเพียงเล็กน้อย เช่น การที่พม่าสามารถเอาชนะอยุธยาในความพยายามที่จะยึดล้านนาและมะริดในช่วงปี 1662–1664 หลังจากนั้นอาณาจักรก็สงบสุขเป็นส่วนใหญ่ตลอดศตวรรษที่ 17

แต่ในช่วงศตวรรษที่ 18 อาณาจักรเริ่มเสื่อมถอยลง อำนาจของกษัตริย์ในพระราชวังก็อ่อนแอลงอย่างรวดเร็วในช่วงปี 1720 เป็นต้นมา ตั้งแต่ปี 1724 ชาวเมเตยได้เริ่มการโจมตีบริเวณแม่น้ำชินด์วินตอนบน และในปี 1727 ล้านนาตอนใต้ (เชียงใหม่) ก็ประสบความสำเร็จในการกบฏ ทำให้เหลือล้านนาตอนเหนือ (เชียงแสน) ที่ยังคงอยู่ภายใต้การปกครองของพม่าอย่างเป็นทางการ ช่วงปี 1730 ชาวเมเตยได้ขยายการโจมตีลึกเข้าไปในพม่าตอนกลางมากขึ้นเรื่อย ๆ

ในปี 1740 ชาวมอญในพม่าตอนล่างเริ่มการกบฏและก่อตั้งอาณาจักรหงสาวดีขึ้นใหม่ และภายในปี 1745 ก็สามารถควบคุมพม่าตอนล่างได้ส่วนใหญ่ นอกจากนี้อยุธยายังได้ขยายอำนาจขึ้นมาทางชายฝั่งตะนาวศรีจนถึงปี 1752 ในปี 1751 อาณาจักรหงสาวดีได้บุกพม่าตอนบน และยึดกรุงอังวะได้ในวันที่ 23 มีนาคม 1752 เป็นการสิ้นสุดราชวงศ์ตองอูที่ยาวนานถึง 266 ปี